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43 人阅读发布时间:2026-05-21 13:52

三代测序(如PacBio SMRT、Oxford Nanopore)凭借其无需PCR扩增、可对单分子DNA模板直接测序的优势,正在成为基因组研究的重要工具。在这一技术流程中,DNA片段化是决定测序质量的关键前处理步骤—需要将高质量、完整性好的基因组DNA精确打断至特定片段长度。
目前主流片段化方法(如g-TUBE、Megaruptor等),存在以下痛点:
成本高昂:单次耗材费用居高不下
通量有限:难以满足大批量样本同时处理
耗时长:处理效率低
操作繁琐:依赖专用耗材
为此,PacBio携手MP Bio联合开发了基于FastPrep-96™ Pro样品制备仪 的基因组DNA片段化技术方案,大大降低了检测成本。






FastPrep-96™ Pro片段化的原理高速震荡产生的液体机械剪切力
FastPrep-96™ Pro片段化的特点仅需PCR管或离心管,单个样本打断成本可忽略不计
将基因组DNA加入管中运行仪器即可进行打断操作
快速高效,可同时处理至多192个样本,无需前处理,打断时间10 min内
通过调整仪器参数即可灵活调整剪切片段长度,满足不同样本需求
打断一致性优秀,经客户多次验证
既适用于样本裂解(如组织、细胞、环境样本等),也可高效完成三代测序DNA片段化,提升设备利用率

FastPrep-96™ Pro片段化应用的案例分享
案例一
样本类型:人全血DNA;
片段化参数及结果:

表1:不同剪切条件的HiFi read数量中值和HiFi read读长(bp)中值

图1:未剪切的DNA和四种剪切条件下DNA片段大小分布

图2:四种剪切条件下HiFi read读长分布
案例二
样本类型:纯菌基因组DNA;
片段化结果:



