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当植物样本遇上三代测序:HMW DNA提取如何兼顾完整性、纯度与通量?

92 人阅读发布时间:2026-06-03 09:45

新闻图片1

随着PacBio、Nanopore等三代测序平台的快速发展,植物基因组测序项目对高质量HMW DNA(高分子量DNA)的需求持续增长。由于三代测序无需PCR扩增,其对DNA完整性、纯度及总量要求明显高于常规二代测序。

然而,植物样本本身复杂性较高,尤其是:

  • 多糖、多酚含量高

  • 不同植物物种间差异大

  • 在保证充分裂解的同时尽可能减少DNA剪切损伤

这些导致三代测序中植物基因组DNA提取难度明显增加。而目前行业内的主流提取方案仍然采用液氮研磨搭配手提法如CTAB法新闻图片2等。在实际操作中,往往存在以下问题:

  • 操作步骤繁琐,严重依赖人工经验

  • 通量低,难以满足批量项目需求

  • 提取流程耗时长

  • 不同样本间一致性差

  • 困难样本得率、纯度与完整性难兼顾

MP 植物三代测序解决方案

针对植物三代测序项目,MPbio可提供从样本裂解、HMW DNA提取到DNA片段化的整体解决方案。

方案特点
  • 既可搭配机械研磨提高通量也可以搭配传统液氮研磨法处理

  • 专用于三代测序的HMW DNA提取方案MP提供针对植物HMW DNA提取优化的磁珠法试剂盒满足大部分常规三代测序需求。

  • 支持自动化与高通量提取更加适用于三代测序公司的规模化项目需求,大大降低人工成本。

  • 提供产品定制服务不同测序平台、不同样本类型,对DNA长度、纯度及总量要求往往存在差异,MP可根据客户实际需求提供定制化服务。

MP服务内容.png
案例分享
1:常规植物样本(绿萝、小麦、水稻等常见植物叶片)提取效果

MP 机械研磨方案搭配专用的磁珠法HMW DNA提取试剂盒

image.png

【结果分析】:条带>20 kb,电泳条带锐利、无弥散拖尾现象

备注】:本结果为某实验室的项目需求。针对具体实验需求,MP可灵活优化提取方案,满足不同客户需求。

2:困难样本(女贞属树叶)的提取效果

液氮研磨方案搭配专用的磁珠法HMW DNA提取试剂盒

image.png

【结果分析】:针对复杂的树叶叶片(富含多糖多酚及色素)提取片段完整性良好,片段长度>48kb,满足常规三代测序提取要求。

 

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